Tyrone Rodriguez von Nicalis äußerte sich in einem Interview mit Destructoid über das kommende Cave Story+ für den Nintendo 3DS eShop. Dabei wird das Spiel kein freies Update werden, falls man bereits die Version vom DSiWare gekauft hat. Wer die verbesserte Version haben will, muss leider Cave Story+ neu erwerben.
Auch könnte leider die 3DS-Version nicht mit der Steam-Version in Grafik und Musik mithalten. Rodriguez relativiert das Problem aber dadurch, dass er versichert, dass HD-Sprites auf dem Handheldbildschirm ohnehin keinen großen Unterschied machen würden und die Musik aus dem Original immer noch klasse wäre.
Für die Steam-Version deutete er auch ein Update an, das ein Leaderboard hinzufügen könnte.