Shin'en hat neue Bilder zu ihrem ersten 3DS Projekt Nano Assault veröffentlicht, das Game soll im Herbst 2011 erscheinen.
In Nano Assault geht es darum einen gefährlichen Virus im Mikrokosmos zu bekämpfen, viele Zellen sind bereits infiziert. Das Game handelt im Nanostray-Universum und führt die Story von Nanostray 2 zu Ende, spielerisch ist Nano Assault jedoch komplett eigenständig.
Der Spieler kann sich frei im Dreidimensionalen Raum bewegen, laut Linzer ergeben sich dadurch fantastische Perspektiven. Die virtuelle Kamera wechselt die Perspektiven je nach Spielabschnitt oder Gegner.