Das ehemalige Projekt Perfect Dark Core sollte sich vom Original des N64 unterscheiden und war als legitimer Nachfolger geplant. Nicht nur eine deutlich veränderte, weniger weibliche Joanna Dark (flirten, rauchen) war geplant, eine "realistischere Atmosphäre" als in den Vorgängern sollten das Game ausmachen. Vor der Einstellung des Projekts spielte man zum Beispiel einen männlichen Charakter der auch Mechs steuern konnte.
Letzten Endes gab es jedoch noch weit mehr Änderungen, so dass das Game eigentlich gar kein richtiges Perfect Dark mehr war und die Entwicklung eingestellt wurde.