Ohne Erinnerung, dafür aber mit ungewöhlichen Superkräften, erwacht Alex Mercer auf einem Seziertisch in einem New Yorker Krankenhaus.
Bei Prototype, dem neuesten Spiel von Radical Entertainment, versucht ihr herauszufinden wer Alex wirklich ist und wem er das alles zu verdanken hat.
Natürlich stellen sich euch dabei genügend Gegner in die Quere, aber um hinter das wahre Ausmaß der Geschichte von Prototype zu kommen muss sich Alex Dingen in den Weg stellen die evtl. sogar seine Kräfte übersteigen oder ihm ähnlicher sind als er sich vorstellen mag.
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Ab dem 12. Juni 2009 gehts los.