Wie in den Heimkonsolenversionen wird man in Golden Eye DS: Rogue Agent auf die dunkle Seite wechseln. Man verlässt das MI6 und kämpft für Auric Goldfinger um die Vormachtstellung in der Unterwelt gegen Dr. No. Während eines Kampfes verliert man ein Auge, welches dann von Goldfingers Forschern durch ein goldenes, künstliches und mit besonderen Fähigkeiten ausgestattetes Auge ersetzt. Das erklärt vielleicht auch den Titel des Spiels.
Man wird im Verlaufe des Spieles auf viele bekannte Charaktere wie Oddjob, Dr. No und Goldfinger aus der Welt von 007 treffen. Die Nintendo DS Version des Spiels wird einige Besonderheiten haben. Auf dem oberen Bildschirm wird das eigentliche Spiel präsentiert, während man auf dem Touchscreen alle Anzeigen übersichtlich zu sehen bekommt.
Zurzeit ist das Spiel für Juni 2005 angekündigt.
