Schon viele Spiele in dieser Generation wurden mit sogenannten Special/Limited/Collector's-Editionen bedacht - und auch BioShock 2 wird da keine Ausnahme machen. Die Special Edition des Spiels wird demnach in einer rund 30x30cm großen Premium-Verpackung daher kommen. In dieser Box befinden sich neben dem Spiel auch noch drei Poster mit Werbeanzeigen aus Rapture, eine CD mit dem orchestralen BioShock 2 Soundtrack, ein 164-seitiges Hardcover-Artbook und, als besonderes Schmankerl, eine Vinyl-Schallplatte mit dem orchestralen Soundtrack des ersten Teils.
Die Special Edition kommt für $99,99 gleichzeitig mit der Standard-Version am 9. Februar 2010 in den Handel.